MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azotobacter vinelandii DJ chromosome

Total Repeats: 118014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012560	GCA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
2	NC_012560	GCT	2	6	133	138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
3	NC_012560	CGA	2	6	142	147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
4	NC_012560	GCCC	2	8	151	158	0 %	0 %	25 %	75 %	226942171
5	NC_012560	CGA	2	6	205	210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
6	NC_012560	CTG	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
7	NC_012560	GCA	2	6	336	341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
8	NC_012560	TCCGC	2	10	350	359	0 %	20 %	20 %	60 %	226942171
9	NC_012560	GC	3	6	358	363	0 %	0 %	50 %	50 %	226942171
10	NC_012560	CCG	3	9	380	388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942171
11	NC_012560	GGC	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942171
12	NC_012560	CGCA	2	8	433	440	25 %	0 %	25 %	50 %	226942171
13	NC_012560	G	6	6	502	507	0 %	0 %	100 %	0 %	226942171
14	NC_012560	TCG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
15	NC_012560	CCAA	2	8	570	577	50 %	0 %	0 %	50 %	226942171
16	NC_012560	GC	4	8	581	588	0 %	0 %	50 %	50 %	226942171
17	NC_012560	CGC	3	9	586	594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942171
18	NC_012560	TGG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942171
19	NC_012560	GGTC	2	8	652	659	0 %	25 %	50 %	25 %	226942171
20	NC_012560	ATC	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942171
21	NC_012560	GAA	3	9	703	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942171
22	NC_012560	GGT	2	6	724	729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942171
23	NC_012560	TCG	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
24	NC_012560	CTG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
25	NC_012560	CGA	2	6	835	840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
26	NC_012560	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226942171
27	NC_012560	AAG	2	6	857	862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942171
28	NC_012560	AGG	2	6	873	878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226942171
29	NC_012560	GGC	2	6	911	916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942171
30	NC_012560	CAG	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
31	NC_012560	GAG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226942171
32	NC_012560	TGA	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942171
33	NC_012560	ACG	2	6	1089	1094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942171
34	NC_012560	CTT	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226942171
35	NC_012560	GC	3	6	1146	1151	0 %	0 %	50 %	50 %	226942171
36	NC_012560	ACCA	2	8	1181	1188	50 %	0 %	0 %	50 %	226942171
37	NC_012560	CTG	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
38	NC_012560	TAC	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942171
39	NC_012560	AAGATC	2	12	1295	1306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226942171
40	NC_012560	TCGC	2	8	1327	1334	0 %	25 %	25 %	50 %	226942171
41	NC_012560	CGG	2	6	1420	1425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942171
42	NC_012560	TCC	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226942171
43	NC_012560	CTG	2	6	1514	1519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942171
44	NC_012560	ACC	2	6	1529	1534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226942171
45	NC_012560	CTG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
46	NC_012560	CGT	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
47	NC_012560	TGC	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
48	NC_012560	GTC	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
49	NC_012560	AGC	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942172
50	NC_012560	GGTC	2	8	1724	1731	0 %	25 %	50 %	25 %	226942172
51	NC_012560	GGA	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226942172
52	NC_012560	GC	3	6	1779	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	226942172
53	NC_012560	GCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
54	NC_012560	CCG	2	6	1918	1923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942172
55	NC_012560	CAG	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942172
56	NC_012560	CTA	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942172
57	NC_012560	TGC	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
58	NC_012560	CGG	2	6	2054	2059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942172
59	NC_012560	TGC	2	6	2062	2067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
60	NC_012560	GC	3	6	2066	2071	0 %	0 %	50 %	50 %	226942172
61	NC_012560	GC	3	6	2178	2183	0 %	0 %	50 %	50 %	226942172
62	NC_012560	CCA	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226942172
63	NC_012560	TTCACC	2	12	2256	2267	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	226942172
64	NC_012560	CG	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	226942172
65	NC_012560	AAG	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942172
66	NC_012560	TGC	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
67	NC_012560	CTG	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
68	NC_012560	CAA	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942172
69	NC_012560	GCG	2	6	2500	2505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942172
70	NC_012560	TGA	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942172
71	NC_012560	CAG	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942172
72	NC_012560	GTC	2	6	2646	2651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942172
73	NC_012560	CGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942173
74	NC_012560	CAGC	2	8	2846	2853	25 %	0 %	25 %	50 %	226942173
75	NC_012560	GCT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942173
76	NC_012560	CGC	2	6	3084	3089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942173
77	NC_012560	GT	3	6	3106	3111	0 %	50 %	50 %	0 %	226942173
78	NC_012560	AAC	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942173
79	NC_012560	GCC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942173
80	NC_012560	GCGA	2	8	3243	3250	25 %	0 %	50 %	25 %	226942173
81	NC_012560	TGG	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942173
82	NC_012560	CTA	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942173
83	NC_012560	GCTC	2	8	3376	3383	0 %	25 %	25 %	50 %	226942173
84	NC_012560	TGC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942173
85	NC_012560	CG	3	6	3409	3414	0 %	0 %	50 %	50 %	226942173
86	NC_012560	GGCC	2	8	3437	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	226942173
87	NC_012560	CTGCGC	2	12	3459	3470	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	226942173
88	NC_012560	CG	3	6	3502	3507	0 %	0 %	50 %	50 %	226942173
89	NC_012560	CAG	2	6	3510	3515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942173
90	NC_012560	TGG	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942173
91	NC_012560	TCG	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942173
92	NC_012560	ATCT	2	8	3582	3589	25 %	50 %	0 %	25 %	226942173
93	NC_012560	CGA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942173
94	NC_012560	GC	4	8	3629	3636	0 %	0 %	50 %	50 %	226942173
95	NC_012560	GAA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942173
96	NC_012560	TCA	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942173
97	NC_012560	CTC	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226942174
98	NC_012560	GTAT	2	8	3867	3874	25 %	50 %	25 %	0 %	226942174
99	NC_012560	CGA	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
100	NC_012560	CAC	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226942174
101	NC_012560	GGT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942174
102	NC_012560	TCGA	2	8	3935	3942	25 %	25 %	25 %	25 %	226942174
103	NC_012560	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
104	NC_012560	GAA	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942174
105	NC_012560	TCA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942174
106	NC_012560	TGC	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942174
107	NC_012560	CGA	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
108	NC_012560	GGT	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942174
109	NC_012560	GAG	2	6	4178	4183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226942174
110	NC_012560	CCG	2	6	4198	4203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942174
111	NC_012560	TCCT	2	8	4376	4383	0 %	50 %	0 %	50 %	226942174
112	NC_012560	AGA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942174
113	NC_012560	GGC	2	6	4451	4456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942174
114	NC_012560	TCG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942174
115	NC_012560	CAA	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942174
116	NC_012560	GAG	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226942174
117	NC_012560	ACG	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
118	NC_012560	CAA	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942174
119	NC_012560	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942174
120	NC_012560	GAC	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
121	NC_012560	CGA	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
122	NC_012560	ATC	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942174
123	NC_012560	AGTTC	2	10	4788	4797	20 %	40 %	20 %	20 %	226942174
124	NC_012560	CCG	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942174
125	NC_012560	CTG	2	6	4877	4882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942174
126	NC_012560	GGT	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226942174
127	NC_012560	GAT	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942174
128	NC_012560	GCC	2	6	4928	4933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942174
129	NC_012560	GC	3	6	4949	4954	0 %	0 %	50 %	50 %	226942174
130	NC_012560	CGC	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942174
131	NC_012560	GC	3	6	4983	4988	0 %	0 %	50 %	50 %	226942174
132	NC_012560	TCG	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942174
133	NC_012560	CCG	2	6	5076	5081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942174
134	NC_012560	GC	3	6	5162	5167	0 %	0 %	50 %	50 %	226942174
135	NC_012560	CTC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226942174
136	NC_012560	ACA	2	6	5244	5249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942174
137	NC_012560	CAT	4	12	5272	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226942174
138	NC_012560	CTG	3	9	5321	5329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942174
139	NC_012560	TCT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226942174
140	NC_012560	GCC	2	6	5389	5394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942174
141	NC_012560	GAA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942174
142	NC_012560	GAC	2	6	5438	5443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942174
143	NC_012560	GGA	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226942174
144	NC_012560	TGA	2	6	5565	5570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942174
145	NC_012560	CG	3	6	5634	5639	0 %	0 %	50 %	50 %	226942174
146	NC_012560	CTGG	2	8	5680	5687	0 %	25 %	50 %	25 %	226942174
147	NC_012560	CTT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226942174
148	NC_012560	CTG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942174
149	NC_012560	GCG	2	6	5917	5922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942174
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152	NC_012560	AAC	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942174
153	NC_012560	TG	3	6	6205	6210	0 %	50 %	50 %	0 %	226942174
154	NC_012560	GAA	2	6	6504	6509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226942175
155	NC_012560	TCG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942175
156	NC_012560	TTCG	2	8	6564	6571	0 %	50 %	25 %	25 %	226942175
157	NC_012560	CTG	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942175
158	NC_012560	CG	3	6	6712	6717	0 %	0 %	50 %	50 %	226942175
159	NC_012560	CCG	2	6	6732	6737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942175
160	NC_012560	CAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226942176
161	NC_012560	GTC	2	6	6903	6908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942176
162	NC_012560	AGT	2	6	6930	6935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942176
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164	NC_012560	TCGG	2	8	6948	6955	0 %	25 %	50 %	25 %	226942176
165	NC_012560	CGA	2	6	6975	6980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942176
166	NC_012560	GGCC	2	8	6993	7000	0 %	0 %	50 %	50 %	226942176
167	NC_012560	AAC	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226942176
168	NC_012560	GCCG	2	8	7068	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	226942176
169	NC_012560	GCCG	2	8	7194	7201	0 %	0 %	50 %	50 %	226942176
170	NC_012560	AGGC	2	8	7225	7232	25 %	0 %	50 %	25 %	226942176
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172	NC_012560	GCT	2	6	7279	7284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942176
173	NC_012560	CGA	2	6	7311	7316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942176
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175	NC_012560	GGTCA	2	10	7372	7381	20 %	20 %	40 %	20 %	226942176
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180	NC_012560	GCT	2	6	7537	7542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942176
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186	NC_012560	CTC	2	6	7675	7680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226942176
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189	NC_012560	CGA	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942177
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193	NC_012560	CCCT	2	8	8204	8211	0 %	25 %	0 %	75 %	226942177
194	NC_012560	GCT	2	6	8230	8235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942177
195	NC_012560	GTC	2	6	8239	8244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942177
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198	NC_012560	GCG	2	6	8273	8278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942177
199	NC_012560	TCC	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226942177
200	NC_012560	GTT	2	6	8305	8310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226942177
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202	NC_012560	ACC	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226942177
203	NC_012560	GGC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942177
204	NC_012560	AGC	2	6	8477	8482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942177
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213	NC_012560	AGC	2	6	8717	8722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942177
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220	NC_012560	GC	3	6	9242	9247	0 %	0 %	50 %	50 %	226942178
221	NC_012560	CGGC	2	8	9335	9342	0 %	0 %	50 %	50 %	226942178
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230	NC_012560	CAG	2	6	9820	9825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942178
231	NC_012560	GAC	2	6	9841	9846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942178
232	NC_012560	CAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226942178
233	NC_012560	GAT	2	6	9924	9929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942179
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241	NC_012560	GGCG	2	8	10332	10339	0 %	0 %	75 %	25 %	226942179
242	NC_012560	TCC	2	6	10373	10378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226942179
243	NC_012560	TGA	2	6	10410	10415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226942179
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245	NC_012560	GCG	2	6	10624	10629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942180
246	NC_012560	CGG	2	6	10632	10637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942180
247	NC_012560	GCGG	2	8	10641	10648	0 %	0 %	75 %	25 %	226942180
248	NC_012560	TGC	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942180
249	NC_012560	CTG	2	6	10663	10668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942180
250	NC_012560	GCC	2	6	10724	10729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226942180
251	NC_012560	GGC	2	6	10806	10811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942180
252	NC_012560	CAGGTC	2	12	10837	10848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226942180
253	NC_012560	AGGCCG	2	12	10851	10862	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	226942180
254	NC_012560	GC	3	6	10871	10876	0 %	0 %	50 %	50 %	226942180
255	NC_012560	GC	3	6	10922	10927	0 %	0 %	50 %	50 %	226942180
256	NC_012560	TGGC	2	8	11009	11016	0 %	25 %	50 %	25 %	226942180
257	NC_012560	GCT	2	6	11037	11042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942180
258	NC_012560	GCG	2	6	11072	11077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942180
259	NC_012560	TGC	2	6	11100	11105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942180
260	NC_012560	GGC	2	6	11111	11116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942180
261	NC_012560	CGG	2	6	11169	11174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226942180
262	NC_012560	GCGCCG	2	12	11201	11212	0 %	0 %	50 %	50 %	226942180
263	NC_012560	CG	3	6	11211	11216	0 %	0 %	50 %	50 %	226942180
264	NC_012560	TCG	2	6	11228	11233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226942180
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